Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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