Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED9Q6R2W3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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