Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms