Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD4Q5VX71 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms