Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCID2Q5JVF3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms