Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms