Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms