Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC92Q53HC0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms