Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM1Q2NKQ1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms