Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Q1T7F1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
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