Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms