Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms