Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHBQ15464 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms