Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms