Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms