Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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