Protein–RNA interactions for Protein: Q14790

CASP8, Caspase-8, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8Q14790 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP8Q14790 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP8Q14790 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms