Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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NCOA4Q13772 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCOA4Q13772 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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