Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF5Q13568 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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