Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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