Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF1Q12946 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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