Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms