Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSC1Q08554 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms