Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms