Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms