Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms