Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC5Q00444 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms