Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PKD1P98161 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms