Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms