Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKP1P63208 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms