Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SPCS3P61009 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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