Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms