Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP3P57721 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms