Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRG3P56975 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms