Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms