Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AFMP43652 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AFMP43652 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AFMP43652 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AFMP43652 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms