Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms