Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms