Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms