Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB9P17482 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms