Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPB42P16452 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPB42P16452 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPB42P16452 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms