Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSP16219 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms