Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTN1P12814 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms