Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms