Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms