Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINC1P01008 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms