Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL18O94889 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms