Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms