Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms