Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDE6DO43924 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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